NIfTI文件的Crop处理

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在获取到的NIfTI数据中没有结构像Crop（去脖颈）文件，但是需要使用Crop文件时，可以通过以下方法实现对NIfTI文件的去脖颈处理：

1.打开电脑的命令行窗口：



2.找到MRIcron软件的dcm2nii.exe程序所在位置（也即MRIcron的安装位置）：



3.输入以下命令：
你的dcm2nii.exe文件路径 -gN-m N -n Y -r Y -v N -x Y -o 输出文件夹 待处理的输入文件

例如
D:\software\MRIcron\dcm2nii.exe -g N -m N -n Y -r Y -v N -x Y -o D:\data\test\rawmridata\sub001\anat D:\data\test\rawmridata\sub001\anat\sub001_T1w.nii


4.处理完毕后，在输出文件夹中生成c开头的文件，即为去脖颈处理后的nii文件。如果需要作为平台文件上传，可以将其重命名为_Crop_1后缀。
输出文件：

重命名：